工作目标和指导思想是:夯基础，抓本质，学建平，创特色。走"合格+特长"发展之路。

建水六中始建于1977年，校址原为"黄锦民宅"，占地面积仅12.85亩，是一所发展中的完全中学。随着教育改革的不断发展，红河州将迁建建水六中列为"1650"工程之一，在县委、政府及县教育局的关心支持下，学校于2004年2月8日举行新校奠基典礼，于2005年8月29日正式迁入新校办学，并剥离初中，成为一所高级中学。